En este artículo se realiza un análisis por diferencias de género de la utilización de la plataforma Moodle en estudiantes de ESO y Bachillerato. El análisis queda justificado por la necesidad de conocer la opinión de los estudiantes ante una manera de trabajar novedosa y completamente distinta a la que habían utilizado años anteriores. Asimismo se han realizado análisis de diferencias de género con el fin de conocer las percepciones sobre el trabajo con la nueva plataforma de cada uno de los sexos. Todo ello podrá servir como punto de partida para aquellos profesores que deseen emprender la implantación de Moodle en los institutos donde trabajen.